Concluída a 2ª Fase da 49ª Copa São Paulo/2018, o Atlético, eliminado na mesma pelo Boavista (RJ), nos pênaltis, ficou dentre os 128 times participantes da competição, na 39ª colocação.
De qualquer maneira é a melhor colocação alcançada pelo Atlético na competição, tendo ultrapassado a 1ª Fase da mesma pela 2ª vez e de maneira consecutiva. A melhor colocação atleticana até então foi o 47º lugar alcançado no ano passado.
Foram 4 jogos realizados com 2 vitórias e 2 empates, 8 gols pró x 4 gols contra, saldo positivo de 4 gols. Os artilheiros rubro-negros foram: Cristyan 4 gols. Jean, Pablo, Alisson e Sávio 1 gol.
