Com o objetivo de atender a demanda dos clubes por um calendário anual de atividades, a CBF oficilizou nesta terça-feira, dia 22 de março, uma semana após oficializar o aumento de 40 para 48 o número de times participantes no Brasileiro da Série D/2016, novo aumento no número de equipes participantes na competição, passando agora de 48 para 68, comtemplando então com mais uma vaga todas as 20 Federações que não tinham sido beneficiadas quando do aumento anterior no dia 15 de março.
Em função desta nova modificação, fica também alterado o sistema de disputa do Campeonato, que passa a ser o seguinte: na 1ª Fase, as 68 equipes ficam divididas em 17 grupos de quatro times em cada grupo, com os jogos acontecendo dentro dos respctivos grupos em turno e returno, seis jogos para cada time, três em casa e três fora de casa, classificando-se o primeiro colocado de cada um dos dezessete grupos, e, dentre os dezessete segundos colocados, os quinze de melhor índice técnico, perfazendo um total de 32 equipes classificadas para a 2ª Fase. A partir daí, eliminatória simples, com jogos de ida e volta, implicando 16 times nas Oitavas de Final, oito nas Quartas de Final, quando acontece a definição do acesso à Série C para o ano seguinte, 2017, os quatro semifinalistas e os dois finalistas que decidem o título de campeão da competição.
Os quatro times que conquistam o acesso para a Série C continuarão precisando ultrapassar quatro fases, disputando até a mesma 12 jogos. Até o ano passado, eram três fases, porém também com 12 jogos realizados até o acesso.
A nova vaga goiana para o Brasileiro da Série D/2016 será então preenchida pelo time melhor colocado do Goianão 2016, exceção feita àquelas cinco equipes que já estão inseridas no Campeonato Brasileiro deste ano, quais sejam, Goiás, Atlético e Vila Nova na Série B e Aparecidense e Goianésia na Série D.
