O futebol goiano pela 1ª vez, desde 1994 quando foi implantado de maneira ininterrupta o atual sistema de Séries no Campeonato Brasileiro, passará a ter três representantes no Campeonato Brasileiro da Série B, em 2016. Passa de um para três representantes em função do rebaixamento do Goiás na Série A e o acesso do Vila Nova na Série C em 2015.
Desde que a Série B existe com o acesso regular para a Série A, iniciado a partir de 1988, exceto em 1993 quando não foi disputado e em 2000, quando a Copa João Havelange foi disputada em substituição ao Campeonato Brasileiro que não pôde ser realizado, o futebol goiano só não se fez representar na competição, em 2007, com o seguinte histórico de participantes:
1988 – Atlético (24 participantes)
1989 – Anapolina, Vila Nova, Goiatuba, Atlético e Goiânia (96 participantes)
1990 – Anapolina (24 participantes)
1991 – Anapolina, Goiânia, Atlético e Vila Nova (64 participantes)
1992 – Anapolina (32 participantes)
1994 – Goiás (vice-campeão/acesso) e Goiatuba (24 participantes)
1995 – Goiatuba (24 participantes)
1996 – Atlético e Goiatuba (25 participantes)
1997 – Vila Nova, Atlético e Goiatuba (rebaixado) (25 participantes)
1998 – Vila Nova e Atlético (rebaixado) (24 participantes)
1999 – Goiás (campeão/acesso) e Vila Nova (22 participantes)
2001 – Vila Nova e Anapolina (28 participantes)
2002 – Vila Nova e Anapolina (26 participantes)
2003 – Anapolina e Vila Nova (24 participantes)
2004 – Anapolina e Vila Nova (24 participantes)
2005 – Vila Nova e Anapolina (rebaixada) (22 participantes)
2006 – Vila Nova (rebaixado) (20 participantes) (início da fórmula de pontos corridos)
2008 – Vila Nova (20 participantes)
2009 – Atlético (acesso) e Vila Nova (20 participantes)
2010 – Vila Nova (20 participantes)
2011 – Goiás e Vila Nova (rebaixado) (20 participantes)
2012 – Goiás (campeão/acesso) (20 participantes)
2013 – Atlético (20 participantes)
2014 – Atlético e Vila Nova (rebaixado) (20 participantes)
2015 – Atlético (20 participantes)
Os 20 times integrantes do Brasileiro da Série B/2016 são os seguintes:
- 1 do Pará = Paysandu
- 1 do Maranhão = Sampaio Correa
- 1 do Ceará = Ceará
- 1 de Pernambuco = Náutico
- 1 da Bahia = Bahia
- 1 de Alagoas = CRB
- 3 de Goiás = Atlético, Goiás e Vila Nova
- 1 do Mato Grosso = Luverdense
- 1 de Minas Gerais = Tupi
- 1 do Rio de Janeiro = Vasco
- 2 de São Paulo = Bragantino e Oeste
- 2 do Paraná = Londrina e Paraná
- 3 de Santa Catarina = Avaí, Criciúma e Joinville
- 1 do Rio Grande do Sul = Brasil de Pelotas
O Campeonato permanece com representantes de 14 Estados, ficando 12 Estados sem nenhum time: Roraima, Rondônia, Amapá, Acre, Tocantins, Amazonas, Piauí, Paraíba, Sergipe, Mato Grosso do Sul, Espírito Santo e Rio Grande do Norte mais o Distrito Federal.
De 2015 para 2016, o Estado do Rio Grande do Sul ganha representante no Campeonato, o Brasil de Pelotas, enquanto o Rio Grande do Norte deixa de fazer parte da competição com o rebaixamento do ABC.