Encerrada a Fase de Quartas de Final da Copa Verde/2016 em sua 3ª edição, o Vila Nova, eliminado nesta Fase da competição de maneira invicta, obtém a 5ª colocação dentre os 18 times participantes da Copa em 2016, superando a Cuiabá, Nacional (AM) e Rio Branco (AC) dentre os quatro times eliminados nas Quartas.
Foram 6 jogos realizados com 3 vitórias e 3 empates, 7 gols pró x 1 gol contra = saldo positivo de 6 gols. Seus artilheiros: Dudu 2 gols; Diego Cardoso, Frontini, Luiz Fernando, Zotti e Anderson 1 gol.