A Copa Verde entra em 2016 na sua 3ª edição. O futebol goiano que se ausentou da 1ª edição, em função de datas conflitantes entre esta competição e o Goianão 2014 à época, que para não prejudicar o nosso Campeonato, a FGF houve por bem não participar, no que foi apoiada pelos nossos clubes, e por extensão, de acordo com a legislação vigente, ficou também automaticamente alijado da edição deste ano, 2015, agora entrará pela 1ª vez, por ocasião da 3ª edição da mesma, em 2016.
A Copa Verde 2016 sofre alterações em relação às suas duas edições iniciais. Passa a ter uma Fase Preliminar e o aumento do número de participantes, de 16 para dezoito. São doze vagas para os campeões estaduais dos Estados do Acre, Amapá, Amazonas, Pará, Rondônia, Roraima e Tocantins na região Norte do país, Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e o Distrito Federal na região Centro-Oeste mais o Espírito Santo, este na região Sudeste do Brasil. Quatro vagas, uma para cada Federação dentre as quatro primeiras colocadas destes Estados no Ranking das Federações para 2016 e mais quatro vagas, uma para cada Federação destes Estados que ficaram, após o preenchimento das quatro vagas citadas anteriormente, com apenas um clube, também os quatro Estados primeiros colocados, neste caso, no Ranking das Federações para 2016.
Assim sendo, o futebol goiano fica com duas vagas, uma automática do campeão goiano e a outra do primeiro Ranking citado, onde a Federação Goiana de Futebol é detentora da 1ª colocação dentre estas doze Federações que compõem a competição.
O Goiás, campeão goiano deste ano, não teve interesse de participar da Copa, sendo substituído pela vice-campeã goiana de 2015, a Aparecidense.
Quanto ao Ranking Nacional de Clubes para 2016, o goiano melor colocado, após o Goiás, o Atlético, também não teve interesse em participar, sendo substituído pelo Vila Nova, o melhor colocado a seguir no Ranking Nacional de Clubes para 2016.
O Vila Nova, participante através do Ranking Nacional de Clubes para 2016, entra na Fase Preliminar, quando faz o Jogo 2 diante do Brasília (DF), jogo de ida na quarta-feira, dia 17/02/16, como visitante e partida de volta na quarta-feira, dia 02/03/16, como mandante.
Classificando-se, uma vez que a competição é em eliminatória simples, com jogos de ida e volta, do início ao fim, enfrentará o Luverdense (MT) formando o Grupo E das Oitavas de Final da competição. O classificado jogará as Quartas de Final diante do classificado do confronto entre Gama (DF) x Interporto (TO) formando o Grupo K desta Fase da Copa.
A Aparecidense enfrenta nas Oitavas o Espírito Santo (ES), partida de ida na quarta-feira, dia 09/03/16, como visitante e jogo de volta na quarta-feira, dia 16/03/16, como mandante, formando o Grupo G das Oitavas.
Classificando-se, enfrentará nas Quartas o classificado do confronto entre Cuiabá (MT), o atual campeão da competição, e Comercial (MS) formando o Grupo L deste Fase da competição.