A 4ª edição da Copa do Brasil Sub-17 será realizada de 30 de março a 1º de junho de 2016, com jogos somente nos meios de semana.
A competição continua com o número de trinta e dois clubes em cinco Fases eliminatórias, com partidas de ida e volta. Os clubes participantes são os 20 que estiveram no Campeonato Brasileiro da Série A/2015 e os 12 primeiros colocados da Série B/2015, o que implica dizer que o futebol goiano terá apenas o Goiás na competição, uma vez que o Atlético ao ser apenas o 14º colocado do Brasileiro da Série B/2015, não alcançou classificação.
Os jogos da 1ª Fase serão nas quartas-feiras dias 30 de março e 6 de abril. Nesta etapa, caso o time visitante vença por diferença mínima de 2 gols, não será realizada a partida de volta.
Nas duas primeiras Fases, a ordem de mando de campo é definida pelo ranking de clubes da CBF. A partir da terceira etapa a definição será através de sorteio.
O único representante goiano, o Goiás, na 1ª Fase da Copa do Brasil Sub-17/2016 está no Grupo 11.
O adversário é o Sampaio Correa, com o jogo de ida em São Luís e partida de volta, caso seja necessário, no Estádio Hailé Pinheiro em Goiânia.
O classificado de Goiás x Sampaio Correa terá como adversário na 2ª Fase, o classificado do confronto entre Flamengo x Náutico.