Na partida de volta do Grupo H da Fase Semifinal do Brasileiro da Série C/2013, o Vila Nova foi derrotado pelo Sampaio Correa por 2x1 no Estádio Castelão em São Luis. Como no jogo de ida em Goiânia aconteceu o empate em 0x0, o time maranhense torna-se o 1º finalista da competição, buscando assim o seu 2º título consecutivo dentro das Séries do Campeonato Brasileiro, uma vez que foi o campeão da Série D no ano passado.
O Vila Nova fica fora da Fase Final da competição, porém no entanto, o seu grande objetivo foi conquistado com o acesso de volta à Série B no ano que vem, sendo o único time do Grupo B da 1ª Fase do Campeonato a atingir tal objetivo.
Com quaisquer resultados dos confrontos entre Santa Cruz x Luverdense na outra Semifinal da competição, o Vila Nova fica na 4ª colocação do Campeonato.
