Finalizados os jogos de volta das Oitavas de Final da Copa do Brasil Sub-20 de 2018, o Vila Nova, eliminado nesta Fase da Copa, dentre as 8 equipes eliminadas nesta circunstância, ficou na 15ª colocação, à frente da Chapecoense, a 16ª colocada, sendo sua melhor participação na história da Copa.
Na sua 2ª participação na Copa do Brasil Sub-20, em sua 7ª edição, o Vila Nova realizou quatro jogos, com uma vitória, um empate e duas derrotas, 5 gols pró x 7 gols contra, saldo negativo de 2 gols. Seus artilheiros: João Pedro e Philippe 2 gols. Wandrew (Atlético/MG) 1 gol.