Encerrados os jogos de ida da 1ª Fase da Copa do Brasil Sub-20 de 2017, o Vila Nova, único dos três times goianos na competição, eliminado apenas na ida desta 1ª Fase da Copa, dentre as 4 equipes eliminadas nesta circunstância, dividiu a 29ª colocação com o CRB, ambos à frente do Santa Cruz e América (MG), respectivamente 31º e 32º colocados.
Na sua 1ª participação na Copa do Brasil Sub-20, em sua 6ª edição, o Vila Nova ao perder em casa no seu Estádio Onésio Brasileiro Alvarenga em Goiânia para o atual bi-campeão da competição, o São Paulo, por 2x0, despediu-se apenas com esta partida realizada.