O Vila Nova estreou na Copa do Brasil Sub-20/2017 perdendo por 2x0 para o São Paulo no Estádio Onésio Brasileiro Alvarenga em Goiânia na partida de ida entre os dois times pelo Grupo 1 da 1ª Fase da competição.
Com o resultado, o time vilanovense está eliminado da competição, sem a necessidade da realização da partida de volta. É a 1ª participação do Vila Nova na Copa do Brasil Sub-20.
O São Paulo nas Oitavas de Final terá como adversário o Vasco que também eliminou seu adversário, o América (MG), apenas com o jogo de ida, quando goleou o adversário por 5x1 fora de casa em Sete Lagoas. O time tricolor do Morumbi é o atual bi-campeão da Copa do Brasil Sub-20 em 2015/2016.
