Crac e Anapolina eliminados na 1ª Fase do Brasileiro da Série D/2009 ficaram respectivamente na 29ª e 30ª colocações da competição dentre 39 equipes participantes.
Minas Gerais foi o Estado com o maior número de times classificados para a 2ª Fase da competição: 3 (Tupi de Juiz de Fora,, Uberaba e Uberlândia),, vindo a seguir o Paraná com 2 times (Londrina e Corinthians de Curitiba).
Além de Goiás,, mais 9 Estados ficaram sem representante após a 1ª Fase do Campeonato. São eles: AC,, RR,, TO,, MA,, PI,, PB,, AL,, ES e MS.
